RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究,具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点。除了分析基因表达水平,RNA-Seq还能发现新的转录本、SNP、剪接变体,并提供等位基因特异的基因表达。
RNA-Seq的动态范围更广,且假阳性可能更小,这意味着RNA-S开发者_高级运维eq的数据重复性应当比芯片要高。RNA-Seq能够检测样品中的所有RNA,这对于鉴定细胞的新颖转录本来说是个优点,但同时缺点在于,它检测了总的RNA,而细胞中很大一部分RNA都来自核糖体和线粒体。这限制了其他RNA的读取数量以及这些RNA表达水平的准确性。因此,polyA RNA选择和核糖体RNA去除等方法被开发出来,以便解决这个问题。
然而,这些分离方法有可能会引入潜在误差,影响实验结果。
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