DNA测序在动植物鉴别方面应用如何？有什么最新进展？？

Abraham30 2021-10-01 10:22

最近看到的发表在Science公布油菜基因组测序结果，说明DNA测序技术在植物鉴别方面的应用较快，油菜作为一种主要的经济作物，对其的开发和利用具有重要的意义。

来自法国农业科学研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人员发表了题为“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica开发者_如何学编程 napus oilseed genome”的文章，公布了油菜（Brassica> napus）的基因组序列，这将有助于了解此类植物（包含来自多物种的染色体）的进化历史，以及其在进化过程中的地位。 这一研究成果公布在8月22日Science杂志上。

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不要叫我小呆呆呆 2021-10-01 10:37

开发者_如何转开发
高通量测序技术应用于动植物基因组学和功能基因组学研究，包括全基因组de novo测序、全基因组重测序、简化基因组测序、转录组测序、数字基因表达谱技术、小RNAs 测序、降解组测序和基于测序的表观基因组学技术。

关于全基因组重测序：核心种质资源品系基因组重测序，群体基因组重测序，重测序构建遗传图谱，重测序发现突变位点，基因组重测序用于 GWAS研究和外显子组和目标区域测序。

相比于全基因组重测序, 外显子组和目标区域测序更加经济、 高效。目前, 在医学基因组学研究领域，外显子组和目标区域测序技术已经应用到寻找人类各种疾病相关的致病基因和易感基因的研究中, 而在动植物研究中已有报道主要集中在小鼠中, 在大豆、牛(Bos taurus)、果蝇(Drosophila melanogaster)等物种中也有部分报道。

现在高通量测序已被广泛应用于以转录组测序等为代表的功能基因组学研究中。对有参考基因组序列的物种, 转录组测序数据可以大大丰富和验证对基因组数据的注释, 而该技术本身可用于不同样本间基因表达差异、可变剪接等的比较。在无参考基因组序列的物种中, 转录组测序可以大量且快速地充实该物种的遗传数据库, 这些数据资源可有助于在该物种中进一步开展分子生物学研究。随高通量测序技术而出现的数字基因表达谱DGE)测序、小 RNAs 测序、降解组测序、DNA 甲基化测序、染色质免疫共沉淀 DNA 测序等新方法为科学家们进行分子生物学相关研究提供了更多的选择。

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loveask 2021-10-01 10:45

DNA测序在植物鉴别方面最近有一项关于利用该技术鉴别引起AIDS病人真菌感染的来源树木的研究报道：

研究人员已准确找到一种隐球菌属（Cryptococcus）真菌的环境来源。该真开发者_JS百科菌简直是生长在树上的。该真菌属，由包括Cryptococcus gattii（C. gattii）在内的许多种真菌组成，可引起威胁生命的肺部和脑部感染，并导致1/3的HIV/AIDS病人死亡。它已影响加利福尼亚州南部数十年。

该发现是基于一名13岁女孩的科学项目，她花费整个夏天从受C. gattii影响最严重的洛杉矶附近区域收集土壤和树木样本。

研究人员对这些样本进行DNA测序，并与从受C. gattii感染的AIDS病人身上获得的DNA序列进行比较。结果发现，三个树种的样本在遗传学上与病人样本几乎不可区分。

这三个树种是，卡内里松（Canary Island pine）、桃金娘科常绿树（Pohutukawa）和美国枫香树（American sweetgum）。

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