需要多久才能迎来整合基因组数据的阶段？？

qkoufu2926 2021-11-07 14:36

这个主要还是取决于整个行业生物信息分析的能力水平，目前云计算、超级计算机、样本量都能够支持基因组数据的整合。开发者_如何学编程
而且国内生信的水平，包括团队的规模，都在一步一步提高，这个大家应该是有目共睹的，相信很快就能迎来这样的大时代。

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讨公道ty 2021-11-07 14:41

个人认为，目前已逐步在进行基因组数据的整合。

从计算能力这一方面来说，已经有专门的硬件用于加快基因组数据分析的速度。在过去的十年间，人类基因组的排序成本已经下降了100,000倍，分析时间从13年降到了三天以内。

在研究领域已经有测序中心在分析并存储数据，各中心的数据分别取自少量的病人样本。我们面临的真正挑战是在不同档案间合并这些数据集，并交叉引用病人的病历、临床治疗及效果。

在过去的几年里，私营企业开始介入，并为大众提供基因组分析服务。比如Illumina、Seven Bridges Genomics、Complete Genomics以及其他一些组织，它们使研究人员和私人团体有条件去针对四张图标记映射全基因组序列。Illumina近期发布了HiSeq X Ten，承诺可以用不到1000美元的成本完成基因组测序，这是一个盼望已久的目标。

Illumina已经正式开发者_高级运维推出了一个名为BaseSpace的云计算和存储平台，它能让科学家们对存储在Amazon Web Services上的数据进行排序、分析和协作。大家也可以使用其API和SDK开发生物信息应用。

另一方面，Seven Bridges Genomics在人类基因组排序和分析中综合应用了云计算和NoSQL数据的技术，比如EC2、S3和MongoDB。为了降低数据存储成本，他们还采用了Glacier。Seven Bridges PaaS提供了一个设置数据通道的界面，这些通道可以基于预定义的模型，也可以根据当前任务进行调整。

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