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为什么普通小麦基因组被认为是三大粮食作物中基因组绘制中最难的呢??

开发者 https://www.devze.com 2023-01-15 20:26 出处:网络 作者:StackOverflow社区
00ailsa 开发者_运维技巧 2021-11-07 17:12 因为普通小麦有21条染色体,每条染色体都大而复杂,其中最大的3B染色体有约8亿个遗传密码“字母”,是水稻整个基因组的近3倍大,所以破译3B染色体与小麦基因组是一
00ailsa 开发者_运维技巧 2021-11-07 17:12


因为普通小麦有21条染色体,每条染色体都大而复杂,其中最大的3B染色体有约8亿个遗传密码“字母”,是水稻整个基因组的近3倍大,所以破译3B染色体与小麦基因组是一项“极其复杂的任务”。


miss_涵 2021-11-07 17:26


楼主所说的应该是“中国春”的小麦品种吧,科学家绘制普通小麦基因组,由于从“中国春”中己分离出儿乎全部大约250多个非整倍体,一般认为“中国春”是小麦细胞遗传研究的标准栽培品种。关于“中国春”小麦品种的历史可以参考文献:“中国春”小麦的历史,E.R.Sears T.E.Miller 邹裕春。其基因组大小是大米的40倍,玉米的7倍,而三大粮食作物中的水稻和玉米的基因组测序工作已分别于2002年和2009年完成。

实际上,早在2010年,由英国科学家主导的小麦基因组草图绘制完成,2013年中国学者小麦基因组测序两篇成果同日荣登Nature,中国科学院联合华大基因等处完成了普通小麦A基因组序列草图; 中国农业科学院、华大基因等处对Ae. tauschii基因组进行测序,获得了小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制。而小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制,更是结束了小麦没有组装基因组序列的历史。而目前美国科学家公布的只是小麦的一个品种——“中国春”小麦,也叫做面包小麦。

那仅仅是因为小麦的基因组过大引起测序困难吗?显然还有其他原因,生产上广泛种植的普通开发者_运维技巧小麦是一个异源六倍体,含有A、B和D三个基因组。其基因组不仅大而复杂,重复序列更是达85%以上,这对于基因组装技术是有极高要求的,比如使用SOAP denovo可能组装效果完全达不到要求,如此高重复性的基因组,致使其测序研究才困难重重,研究进展缓慢。


0071234567 2021-11-07 17:36


这是由普通小麦本身基因组的复杂性导致的。我们知道普通小麦种植广泛,是全球约30%人口的主粮。随着全球人口2050年预计达到90亿,有预测称普通小麦须增产70%才能满足未来需求。但普通小麦有21条染色体,每条染色体都大而复杂,其中最大的3B染色体有约8亿个遗传密码“字母”,是水稻整个基因组的近3倍大,所以破译3B染色体与小麦基因组是开发者_如何学C一项“极其复杂的任务”。


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