单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两方面,分别针对单个细胞的DNA和RNA进行序列分析和比较,进而揭示基因组和转录组的变化。近年来,流式细胞分选和激光捕获显微切割技术的出现让单细胞的捕获成为可能。单细胞测序技术正逐渐从实验研究方法成为指导临床的有利工具,为基础研究向临床转化搭建了桥梁。
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组之后通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
单细胞转录组分析主要用于在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。与活细胞成像系统相结合,单细胞转录组分析更有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络。将此技术应用于临床,理论上可以在生理 或病理情况下连续追踪基因表达的动力学变化,从而监测疾病的进展。单细胞转录组分析的另一应用领域是发现亚细胞成分的基因表达谱,例如对在神经元的轴突或树突部分特异表达的基因的转录组的分析,这些基因往往对细胞的生物学功能发挥着重要作用。但是,鉴于目前的技术手段,单细胞转录组测序仍然存在覆盖率低的弊端,导致除mRNA以 外的长非编码RNAs难以检测,并且不能区分正义链与反义链开发者_如何学JAVA。最近发展的单分子测序技术无需逆转录和扩增步骤而直接对单个细胞的全长mRNAs进 行测序,从而准确地检测基因不同的剪切亚型的表达水平。
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