DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱研究进展如何？？

jkloooop 2021-11-17 03:42

　近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破，《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。
DNA磷硫酰化修饰广泛存在于细菌中，与细菌的自我防卫机制紧密相关，然而其序列特异性及在细菌基因组中的分布情况尚无报道。本工作以大肠杆菌Escherichia coliB7A为研究对象，建立了单分子实时测序（single molecule real-time s开发者_如何学编程equencing，SMRT）和碘切割依赖的深度测序（deep sequencing of iodine-induced cleavage at PT，ICDS)两种新颖的技术，测定了基因组水平DNA磷硫酰化修饰位点，首次获得了精确的细菌基因组磷硫酰化修饰位点分布图谱。
文章链接：http://www.nature.com/ncomms/2 ... .html

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小小_994 2021-11-17 0开发者_Go百科3:47

近日，从上海交通大学获悉，该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。
DNA是生命的遗传物质，由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化修饰。这一现象被国际同行公认为“迄今为止在DNA骨架上发现的第一个天然修饰”，也是目前在DNA骨架上发现的第六种元素。
由德林团队以大肠杆菌Escherichia coli B7A为研究对象，建立了单分子实时测序和碘切割依赖的深度测序等两种前沿技术，测定了基因组水平DNA磷硫酰化修饰位点，首次获得了精确的细菌基因组磷硫酰化修饰位点分布图谱。
据了解，这两种测序方法相互补充，测得修饰位点具有保守的GpsAAC/GpsTTC短序列特征。而大肠杆菌中同样存在一个DNA磷硫酰化修饰—限制系统，并且其基因组中只有部分GAAC/GTTC位点被DNA磷硫酰化修饰酶识别修饰。该发现表明，DNA磷硫酰化修饰—限制系统不同于经典的甲基化修饰—限制系统，具有特殊的作用机制。

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