高继武
2021-04-02 11:55
既然问的是乳腺癌的易感基因，那应该想找的不是像BRAC1，2上面的变异了，当然它们的变异可以去clinvar或HGMD上找，还有几个Brac1，2专有的数据库，我记不清地址了。私有的数据库，应该首推myriad的，不过应该你看不到，这是别人吃饭的家伙。
然后说易感位点。通过GWAS技术，前人已经找到很多跟乳腺癌相关的SNP位点了，你可以去gwas catalog里面看看，搜breast cancer，asso开发者_Python百科ciation有375个，可以导出表格，当然后面还要手工过滤一下，里面会有一些无关信息。要嫌不够，去pubmed上找文献吧，优先找meta-analysis的文献。各个位点对于乳腺癌的危险程度，看OR值，大部分的位点研究者还都会给OR的。初步分析就看这些了，当然要深入研究，还要考虑样本量，人种，meta-analysis等问题，不知道你的研究目的，很难在这里细说了。
既然问的是乳腺癌的易感基因，那应该想找的不是像BRAC1，2上面的变异了，当然它们的变异可以去clinvar或HGMD上找，还有几个Brac1，2专有的数据库，我记不清地址了。私有的数据库，应该首推myriad的，不过应该你看不到，这是别人吃饭的家伙。
然后说易感位点。通过GWAS技术，前人已经找到很多跟乳腺癌相关的SNP位点了，你可以去gwas catalog里面看看，搜breast cancer，asso开发者_Python百科ciation有375个，可以导出表格，当然后面还要手工过滤一下，里面会有一些无关信息。要嫌不够，去pubmed上找文献吧，优先找meta-analysis的文献。各个位点对于乳腺癌的危险程度，看OR值，大部分的位点研究者还都会给OR的。初步分析就看这些了，当然要深入研究，还要考虑样本量，人种，meta-analysis等问题，不知道你的研究目的，很难在这里细说了。
![Interactive visualization of a graph in python [closed]](https://www.devze.com/res/2023/04-10/09/92d32fe8c0d22fb96bd6f6e8b7d1f457.gif)
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