说实话,不知是文案编辑水平问题还是其他原因,一段话读下来觉得各种语焉不详。
“在中国人中影响最大的乳腺癌基因是ESR1(雌激素受体基因),中国一半的乳腺癌患者和这个基因有关。ESR1的一个风险变异使乳腺癌的风险上升30%,双份变异上升66%,和高胆固醇对冠心病的贡献差不多了”
这个“ESR1基因在中国人中影响最大,中国一半的乳腺癌患者和这个基因有关。”,是指何种有关?是基因的表达阳性情况吗?现在常规乳腺癌检测指标中的确都有ER表达水平的检测,可接下来的描述“ESR1的一个风险变异使乳腺癌的风险上升30%,双份变异上升66%”从这句话中可以推断出原来徐博的意思是ESR1基因上存在的“风险位点”,也就是DNA水开发者_JAVA技巧平上的“碱基变异”会对中国人群乳腺癌风险造成影响。
问题来了,ESR1基因的“风险变异”是影响乳腺癌患病风险,那么是通过什么形式来影响?“一个风险变异上升30%”之后,“双份变异上升66%”。绞尽脑汁能猜测这句话可能是想用来表达这个SNP位点的杂合基因型和纯合基因型的风险位点,于是按照这个思路简单在PUBMED上检索了一下包含“ESR1”,“BREAST CANCER”,“CHINESE”,“RISK”等相关关键词的研究文献,发现几十篇研究ESR1基因与中国人群乳腺癌风险相关的文献(只随便找了一些PMID:24127041,23486537,23272245,21528353,22879957,23609471,19760036,25116933)。某些GWAS研究发现ESR1基因一系列相关SNP位点(rs2046210,rs2228480,rs3798758,rs3734805,rs3757318,rs9383951,rs2747648, rs1062577, rs3020314)经过统计学分析表明与乳腺癌风险升高/降低相关。如果没弄错,这类文献中“一个风险变异”其实指外显率较低的常见多态性位点,所造成的风险升高/降低大多以HR/RR/OR表述,不知道报道所言”30%“和”66%“是否指OR/RR/HR=1.3/1.66。然而前文“BRCA1,这个基因突变使乳腺癌的风险高达87%”中87%是积累风险(cumulative risk,定义可参考文献PMID: 9497246),两者在定义,计算方式,用途等方面均无法直接比较。混淆这些概念,是否有鱼目混珠之嫌?
当然,如果有ESR1基因在中国人群乳腺癌方面的积累风险研究,希望能分享并共同学习。
除此之外,检索过程中,一些研究发现ESR1基因上部分SNP位点多态性可能与ER表达情况相关(PMID: 19760036,25116933),至于这些SNP位点多态性影响ER表达以致与乳腺癌的关联仍需要通过湿实验探明。
维达健公司创始人徐博士在哈佛公卫学院从事过癌症流行病学研究,在GWAS算法上颇有建树(PMCID: PMC3148549),本还轮不到我等班门弄斧之徒来普及概念。只是,不论是否出于推进所在公司基因检测的目的,以上这段存在多处偷换概念的话出自如此专业人士之口,无论如何不能相信。
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